Databáza je definovaná ako organizovaná zbierka údajov alebo informácií, ktoré sú elektronicky uložené a prístupné z počítačového systému. Organizovaná povaha databáz uľahčuje prístup, správu, pravidelnú aktualizáciu a rýchle vyhľadávanie požadovaných údajov/informácií pomocou počítačového systému. Biologické databázy predstavujú súhrn údajov týkajúcich sa biologických vied.
S prudkým rastom údajov a informácií rastie aj počet biologických databáz. Jedným z charakteristických znakov moderného genomického výskumu je generovanie obrovského množstva nespracovaných sekvenčných údajov. Úlohou bioinformatiky je vývíjať databázy na spracovanie veľkého množstva molekulárno-biologických informácií. Biologické databázy predstavujú internetové knižnice obsahujúce štruktúrované informácie o živých organizmoch, integrujú obrovské množstvo údajov, ktoré sú dôležitým výskumným nástrojom nevyhnutným pre vedcov. Každý záznam obsiahnutý v biologickej databáze obsahuje údaje o nukleotidovej sekvencii, proteínovej sekvencii a 3D štruktúre, biologickej povahe, funkcii génu a iných informácií o predkladateľoch, referenciách či zdrojových organizmoch. Biologické databázy sú koherentné, konzistentné a navrhnuté na konkrétny účel na uloženie súboru jasne definovaných údajov organizovaným spôsobom.
K obsahu databázy je možné jednoducho pristupovať, spravovať a aktualizovať. V súčasnosti, sú biologické databázy ústrednou súčasťou bioinformatiky. Prostredníctvom rôznych nástrojov na analýzu údajov možno ľahko získať prístup ku všetkým biologickým informáciám; čím sa šetrí čas, zdroje i námaha.
Biologické dáta sú usporiadané v niekoľkých typoch biologických databáz:
1. PRIMÁRNE
2. SEKUNDÁRNE
3. ŠPECIÁLNE
4. INÉ
Rozdelenie biologických databáz
Na základe ich obsahu možno biologické databázy rozdeliť do nasledujúcich typov.
Usporiadanie informácií v biologických databázach
Niektoré vybrané najznámejšie bioinformatické databázy
Komplexný katalóg celosvetových biologických databáz (https://ngdc.cncb.ac.cn/databasecommons) je verejne dostupný a spravuje celkovo 5825 biologických databáz z 8931 publikácií, ktoré sú geograficky distribuované v 72 krajinách/regiónoch a vyvinuté 1975 inštitúciami.
Využi pri ďalšom štúdiu tejto témy e-learningový kurz.
Prihlás sa do e-learningového kurzu a okrem plnej verzie textovej časti tejto témy získaj prístup aj k:
Ak ešte nemáš prístup k e-learningovému kurzu, prečítaj si, ako ho môžeš získať.