Národné centrum pre biotechnologické informácie (The National Center for Biotechnology Information, skrátene NCBI) bolo založené v roku 1988. Databáza NCBI vznikla ako súčasť Národnej lekárske knižnice NLM (National Library of Medicine) v rámci Národného inštitútu zdravia NIH (National Institute of Health), ktorý sa nachádza na webovej stránke https://www.nih.gov. Národná lekárska knižnica (NLM) je najväčšou biomedicínskou knižnicou na svete s bohatou históriou, podporuje a vedie aj výskum, vývoj a školenia v oblasti biomedicínskej informatiky a zdravotníckych informačných technológií. Propaguje a poskytuje prístup k informáciám o zdraví v komunitách po celých Spojených štátoch.

Množstvo údajov, ktoré databáza NCBI uchováva, sa v priebehu rokov rozšírilo a možno ich všeobecne obsahovo rozdeliť do troch širokých kategórií: literatúra, klinická genetika a biomolekuly. NCBI spravuje rôznorodý súbor takmer 40 databáz, ktoré spolu obsahujú 4,3 miliardy záznamov z ktorých väčšina je dostupná prostredníctvom vyhľadávacieho systému Entrez na https://www.ncbi.nlm.nih.gov/search/.


Vybrané databázy a nástroje NCBI sú zoskupené do troch základných kategórií /Zdroj: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/).

Vybrané súbory databáz, ktoré zastrešuje NCBI (Zdroj: Sayers et al. 2023).

NCBI

Infraštruktúra hlavnej stránky NCBI nás navedie na niekoľko hlavných možností v rámci databázy:
1 – detailný zoznam zdrojov, ku ktorým je dostupný prístup
2 – najčastejšie využívané databázy a nástroje v NCBI
3 – informácie, akým spôsobom vkladať a sťahovať informácie
4 – prístup k pomocným dokumentom, návodom, výskumným projektom
5 –prístup k širokej škále nástrojov na analýzu údajov a ku množstvu zdrojov, ktoré umožňujú vývojárom pristupovať a manipulovať s údajmi NCBI v ich aplikáciách
6 – zoznam všetkých dostupných databáz v NCBI pre výskum a analýzu údajov.

Architektúra hlavnej stránky databázy NCBI.


NCBI ENTREZ

Entrez je vyhľadávací systém vyvinutý spoločnosťou NCBI, ktorý používateľom umožňuje prístup k širokému spektru biomedicínskych a genomických databáz. Slúži ako brána k mnohým zdrojom vrátane PubMed, GenBank, Protein, Nucleotide, Structure a mnohých ďalších. Entrez poskytuje jednotné rozhranie, vďaka ktorému môžu výskumníci vyhľadávať a získavať relevantné informácie z rôznych databáz súčasne

Výsledky vyhľadávania po zadaní kľúčového slova ” vitamin D receptor”.

Pre podrobnejšie informácie o databáze NCBI a jej využití, použi pri ďalšom štúdiu tejto témy e-learningový kurz.

Túto tému nájdeš aj
v e-learningovom kurze

Prihlás sa do e-learningového kurzu a okrem plnej verzie textovej časti tejto témy získaj prístup aj k:

  • prezentáciám tejto témy
  • podporným materiálom k tejto téme
  • možnosti otestovať svoje vedomosti
  • komunikácii s autormi tejto témy
  • diskusnému fóru k tejto téme

Ak ešte nemáš prístup k e-learningovému kurzu, prečítaj si, ako ho môžeš získať.

Predchádzajúca téma

Nasledujúca téma